Kupferenzyme besitzen oft Funktionen, die auch von entsprechenden Eisenverbindungen ausgeübt werden können. Das ergibt sich aus ähnlichen Redoxpotentialen.

Kupferenzyme sind zu finden in

•   Hämocyanin (O₂-Transport)
•   Tyrosinase (Oxygenierungsreaktionen)
•   Nitritreduktase
•   Superoxid-Dismutase (Antioxidationsfunktion)
•   "Blaue" Cu-Proteine

Zur Koordination der Metallionen werden häufig Histidin-, Methionin- oder Cystein-Reste verwendet. Je nach der Funktion des Enzyms können auch Sauerstoff-Donoratome gebunden werden.

Oft sind Kupfer-Zentren mit anderen Metallzentren gekoppelt.